Στην παθογένεια της περιοδοντικής νόσου εκτός από την οδοντική μικροβιακή πλάκα υπάρχουν και άλλοι συνεισφέροντες παράγοντες, όπως το κάπνισμα, οι οποίοι συμμετέχουν δευτεροπαθώς και τροποποιούν τη δράση του παθογενετικού μηχανισμού ή την αντίδραση του οργανισμού.

Σημαντικό ρόλο στην επίδραση του καπνίσματος στην περιοδοντική νόσο φαίνεται ότι διαδραματίζει τόσο ο αριθμός των τσιγάρων σε ημερήσια βάση, όσο και η χρονιότητα του καπνίσματος.

Η νικοτίνη αποτελεί τον πλέον τοξικό παράγοντα από όλα τα συστατικά του καπνού και έχει ενοχοποιηθεί για την πρόκληση μειωμένης φαγοκυττάρωσης την καταστολή της σύνθεσης οστεοβλαστών και την ελλάτωση της ροής του ουλικού υγρού.

Σύμφωνα με τα σύγχρονα ερευνητικά δεδομένα υπάρχει διαφορά ανάμεσα στους καπνιστές και μη καπνιστές σε ότι αφορά στην αποτελεσματικότητα της περιοδοντικής θεραπείας! Αυτό αποδίδεται κυρίως στη βλαβερή επίδραση του καπνίσματος στους ιστούς και όχι τόσο στις μεταβολές στη σύνθεση της υποουλικής πλάκας.

Το κάπνισμα σχετίζεται με μειωμένη επούλωση μετά από εφαρμογή χειρουργικής περιοδοντίου και συγκεκριμένα της τεχνικής της κατευθυνόμενης ανάπλασης των ιστών με μεμβράνες και μοσχεύματα. Υπάρχουν στατιστικά σημαντικές διαφορές στην ελάττωση του βάθους των θυλάκων μεταξύ καπνιστών και μη καπνιστών, ένα χρόνο μετά από χειρουργική περιοδοντική θεραπεία.

Τέλος ορισμένοι ερευνητές υποστηρίζουν ότι οι καπνιστές εμφανίζουν αυξημένο ποσοστό υποτροπής της περιοδοντικής νόσου.